College of Science/ University of MosulRafidain Journal of Science1608-939122120110128Application of the Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers to Analyze the Genetic Variability in Species of the Fungus Alternariaاستخدام مؤشرات التضاعف العشوائي للدنا (RAPD) لتحليل التباين الوراثي لانواع من الفطر Alternaria1163244610.33899/rjs.2011.32446ENHadeel A. OmearAkeel H. Al-AssieSahi J. DhahiJournal Article20110101The PCR-based technique of randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) was used to fingerprint and assess the genetic relatedness among nine species of the fungus Alternaria isolated from various crop plants showing the leaf spot disease in Mosul, Iraq. Genomic DNA of each species was extracted at a final concentration of 300 - 400 µg / 2-3 g of wet mycelium , and at a purity of 1.6-1.8. Each DNA sample was amplified with each of 22 primers and the products were resolved electrophoretically on 1.2% agarose gel, stained with ethidium bromide and photographed under UV. One Primer failed to support amplification but the remaining 21 (95.5%) primers produced a total of 112 bands (2-10 per primer) across the nine species. Of these bands, 100 (1-10 per primer ) were polymorphic. The least efficient primer was OP-H01 (1.79%), while the most efficient one weas OP-M05 (8.93 %). Primers OP-C05, OP-E20 and OP-T20 had the lowest (0.1%) discriminatory power while primer OP-M05 had the highest (10 %) power and identified all 9 species through unique patterns of banding. RAPD analysis fingerprinted eight of the nine isolates through marker bands with one or more of the 21 primers. Cluster analysis based on the genetic distances split the nine species into three distinct clusters with no obvious association between the pattern of clustering of the species and their host specificities.لقد جرى استخدام تقنية RAPD المعتمدة على تفاعل PCR لايجاد البصمة الوراثية والعلاقة الوراثية بين تسعة انواع من الفطر Alternaria المعزولة من نباتات محاصيل مختلفة مصابة بمرض تبقع الاوراق في مدينة الموصل / العراق. وجرى استخلاص الدنا من كل نوع وبتركيز نهائي قدره 400-300 مايكروغرام لكل 3-2غرامات من الغزل الفطري الرطب وبنقاوة 1.8-1.6. وجرت مضاعفة كل عينة من عينات الدنا بواسطة 22 بادئا وفرزت النتائج بالترحيل كهربائيا خلال هلام الاكاروز ذي التركيز 1.2% والمصبغ بالمادة المتألقة بروميد الايثيديوم والتصوير تحت اشعة الــUV. وفيما اخفق احد البوادئ في دعم عملية التضاعف لاي دنا مجيني فقد افلح 21 بادئا اخر في ذلك وانتجت ما مجموعه 112 حزمة دنا ( بمعدل 10-2لكل بادئ) عبر الانواع الفطرية التسعة وكان 100 حزمة من هذه الحزم متباينا ( بمعدل 10-1 لكل بادئ ) وكان اقل البوادئ كفاءة في اسناد التضاعف هو البادئ OP-H01 (بكفاءة 1.79%)، و أكثرها كفاءة (10%) وهو البادئ OP-M05، إذ استطاع ان يميز جميع الانواع التسعة وذلك من خلال الانماط الفريدة من التحزيم في كل نوع. لقد استطاعت تقنية RAPD كذلك تحديد البصمة الوراثية لثمانية انواع من الانواع التسعة المدروسة وذلك من خلال ظهور حزم مؤشرة فريدة حين مضاعفة الدنا من كل نوع من هذه الانواع مع واحد او اكثر من البوادئ الواحد والعشرين أعلاه. كما أن التحليل العنقودي للمسافات الوراثية بين هذه الانواع التسعة قد وضع الانواع في ثلاث مجموعات رئيسة دون ملاحظة وجود علاقة بين توزيع الانواع على هذه العناقيد الثلاثة وتوزيعها على المضائف التي جمعت منها.https://rsci.mosuljournals.com/article_32446_d24d23046c2444379f7cff96e96b0fd1.pdfCollege of Science/ University of MosulRafidain Journal of Science1608-939122120110128Effects of Crude Alkaloids Isolated from Peganum harmala Seeds on the Growth and Metabolism of Leishmania tropica Promastigotesتأثير القلويدات الخام المعزولة من بذور الحرمل Peganum harmala في نمو وايض أمامي السوط لطفيليات اللشمانيا الجلدية Leishmania tropica17323245010.33899/rjs.2011.32450ENMarua H. AL-HammoshiJournal Article20110101The present work aimed to examine the efficacy of Peganum harmala Linn. alkaloids as potential antilieshmanial agents in vitro, and to determine their toxicity in mice.
The study included extraction and isolation of Peganum harmala crude alkaloids from seeds. The isolated fraction that contains alkaloids was detected, using Myer`s and modified Dragendorff`s reagents. Then, the crude alkaloids were tested for their antileishmanial activity against Leishmania tropica promastigotes in vitro including their effects on parasite growth and metabolism.
It was found that the studied alkaloids inhibited growth of the parasite remarkably. The inhibitory concentration of 50% of the promastigotes (IC50) at the log phase (96) hrs was 50 µg of the alkaloids/ ml of culture.
Furthermore, the extracted alkaloidal fraction from Peganum harmala seeds, resulted in decline of RNA, DNA, and protein content of the parasite and reduced specific activity of dihydrofolate reductase and thymidine phosphorelase enzymes. It also had obvious inhibitory effects on energy metabolism of the parasite.
Oral median lethal dose (oral LD50) of the extracted alkaloids was 1070 mg / kg body weight in Balb/c mice, using the up-and-down method.
It can be concluded that Peganum harmala alkaloids show promising antilieshmaneal activity and may have potential role in the search for novel antilieshmaneal drugs, as they affect metabolism of proteins, nucleic acids and energy of the parasite (in vitro) with a slight toxicity in mice (in vivo).يهدف العمل الحالي إلى بيان كفاءة قلويدات نبات الحرمل Peganum harmala (العائلة السذابية) بوصفها مضادات لطفيلي اللشمانيا في الزجاج، ثم تحديد سمية هذه القلويدات في الحيوانات المختبرية. أستخصلت القلويدات الخام لبذور النبات. أستخدم كاشف ماير وكاشف درانكدروف المحور للتحقق من القلويدات المستخلصة. قدرت الفعالية المضادة للشمانيا للقلويدات المستخلصة في الزجاجin vitro باستخدام أمامي السوط للشمانيا الجلديةLeishmania tropica كما قدر تأثير هذه المستخلصات على نمو وأيض الطفيلي. تبين أن القلويدات قيد الدراسة أثرت على نمو الطفيلي بشكل واضح، التركيز القاتل ل50% من أمامي السوط عند الطور اللوغارتمي (96 ساعة) كان 50 مايكرو غرام من القلويدات/ سم3 من المزرعة، فضلا عن تسبب الجزء القلويدي المستخلص في انخفاض محتوى الحامض النووي الرايبوزيRNA والرايبوزي منقوص الأوكسجينDNA والبروتين. وكذلك تسببت في اختزال الفعاليةالنوعية لللأنزيمين دايهايدروفوليت ردكتيز وثايمدين فوسفورليز, فضلا عن تأثيرها التثبيطي الواضح لأيض الطاقة في الطفيلي. الجرعة المميتة الوسطية الفموية كانت 1070 ملغم/كيلوغرام من وزن الجسم في الفئران المختبرية سلالة c Balb/ بطريقة الصعود والنزول. نختم بالقول أن قلويدات الحرمل أعطت فعالية واعدة كمضادات للشمانيا، ويمكن العمل عليها كتراكيب جديدة في مجال بحوث الأدوية المضادة للشمانيا، باعتبار أنها أثرت في أيض البروتين والأحماض النووية والطاقة للطفيلي في الزجاج مع سمية قليلة في الحيوانات المختبرية.https://rsci.mosuljournals.com/article_32450_48dcdd0540c4fef488347a682ff331fe.pdfCollege of Science/ University of MosulRafidain Journal of Science1608-939122120110128A Study of Benthic Macroinvertebrate Community in the Lower Part of Greater Zab River Near Guwer Subdistrictدراسة مجتمع اللافقريات القاعية في الجزء السفلي لنهر الزاب الأعلى قرب منطقة الكوير33453245410.33899/rjs.2011.32454ENYahya A. ShekhaJournal Article20110101In this study, the analysis of 48 qualitative macroinvertebrate samples were taken from four sites in the lower reach of Greater Zab river near Guwer subdistrict- Erbil from May 2008- April 2009. Sixteen taxa belong to Ephemeroptera, Diptera, Plecoptera, Hemiptera, in addition to one taxa belong to class Arachnides were identified. Site 1 is characterized by more identified taxa (12 taxa) than the other sites. Most abundant taxa were Tanypus spp. during studied period which followed by Hydrachna spp., with highest F index percentage reached to 75% and 58.3% respectively. According to Sorenson index, sites 2 and 3 were the most similar sites with values reached to 75%.في الدراسة الحالية , تم تحليل 48 أنموذجاً من اللافقريات العيانية الماخوذة من الجزء السفلي لنهر الزاب الاعلى قرب ناحية الكوير – اربيل, وذلك من خلال اختيار اربع محطات ابتداءً من ايار- 2008 الى نيسان -2009 . تم تشخيص سبعة عشر وحدة تصنيفية عائدة الى الرتب التالية : ذبابة مايو, ثنائية الأجنحة, ذبابة الصخور, نصفية الأجنحة إضافة إلى وحدة تصنيفية عائدة الى صنف العنكبوتيات. تميز الموقع الاول بتواجد وحدات تصنيفية اكثر ( 12 وحدة تصنيفية ) مقارنة مع بقية المواقع. وأكثر الأنواع وفرة خلال فترة الدراسة كانت Tanypus spp. ثم، Hydrachna spp. مع نسبة وفرة عالية وصلت الى 75 % و 58.3 %، على التوالي. اعتمادا على دليل سورنس تبين بان موقع 2 و 3 من اكثر المواقع تشابها مع نسب وصلت الى 75% .https://rsci.mosuljournals.com/article_32454_ee95c34ec878085c75faa2287cd7a8fa.pdfCollege of Science/ University of MosulRafidain Journal of Science1608-939122120110128Histological Adaptation to Thermal Changes in Gills of Common Carp Fishes Cyprinus carpio L.التأقلم النسجي للتغييرات الحرارية في غلاصم اسماك كارب الاعتيادي (Cyprinus crpio L.)46553246410.33899/rjs.2011.32464ENTagrid H. SaberJournal Article20110101Investigations were carried out on the gill tissues of common carp Cyprinus carpio L. exposed to high levels 31oC, and low levels 18oC of temperature for a total period of successive of 10 days. The histological study of the gill sections of this fish species showed marked histological lesions, include hyperplasia and hypertrophy of the respiratory epithelium, bloody congestion with hemorrhage and abundance of mucous substance, this at high temperature, while at low temperature also showed hyperplasia, shrinkage of blood vessels, fusion of secondary lamellae, cellular atrophy, damage and lamellar disorganization. Lesions were comparatively most severity at low temperature.تم إجراء فحوصات على أنسجة الغلاصم في اسماك الكارب الشائعة Cyprinus carpio L. والمعرضة إلى درجات حرارية من مستويات مرتفعة 31مo ومنخفضة 18مo ولمدة عشرة أيام متتالية. أظهرت الدراسة النسجية للمقاطع الغلصمية في هذا النوع من الأسماك آفات نسجية واضحة تضمنت : فرط تنسج وتضخم في النسيج الطلائي التنفسي، احتقان دموي ونزف مع وجود وفرة من المادة المخاطية بين الصفائح الغلصمية الثانوية، هذا عند المستويات المرتفعة من الحرارة، اما عند المستويات المنخفضة من الحرارة أيضا ظهر فرط تنسج ونزف بالإضافة إلى انكماش الأوعية الدموية الغلصمية، اندماج الصفائح الثانوية الغلصمية، ضمور خلوي، تحطم وعدم انتظام صفائحي، وكانت الآفات النسجية أكثر شدة في حالة الحرارة المنخفضة.https://rsci.mosuljournals.com/article_32464_af86c9fcd27abae53abab7a7c4214d82.pdfCollege of Science/ University of MosulRafidain Journal of Science1608-939122120110128Spectrophotometric Determination of Barbituric Acid by Coupling with Diazotized Nitroanilinesالتقدير الطيفي لحامض الباربيتيورك باقترانه مع نايتروانيلين المؤزوت56713247610.33899/rjs.2011.32476ENBatool B. IbraheemJournal Article20110101A simple spectrophotometric method for the trace determination of barbituric acid (BA) has been established. The method is based on the coupling reaction of barbituric acid with diazotized nitroaniline in basic medium to form an intense yellow-water soluble and stable mono azodyes which shows maximum absorption at 418, 380, and 370 nm with diazotized o-, m- and p-nitroanilines, (DONA, DMNA, and DPNA), respectively. A plot of absorbance versus BA concentration was linear to a certain limit, indicating that Beer's law was adhered to over the range 5-300 g of BA/25 ml final volume (i.e., 0.2-12 ppm) with a molar absorptivity of 1.998×104, 2.328×104, and 2.184×104 l mol–1 cm–1 for DONA, DMNA, and DPNA, respectively. Sandell sensitivity indexes were 0.0064, 0.0055, and 0.0059 µg cm–2, while the relative errors were -3.365 to 0.904%, -3.325 to 0.138%, and -2.053 to 2.679% for DONA, DMNA, and DPNA, respectively. The relative standard deviation (RSD) were 0.489 to 3.330, 0.897 to 2.209 and 0.059 to 3.689 for DONA, DMNA and DPNA, respectively. The optimum conditions for the color reaction, nature of dye, stability constant and the interference of variety of organic compounds had been investigated. The method has been successfully applied to the determination of barbituric acid in Tigris water river. The proposed method for the determination of barbituric acid is simple, sensitive, very low cost, has a wide analytical range and without the need for heating or solvent extraction techniques.تم تثبيت طريقة بسيطة لتقدير كميات متناهية في الصغر من حامض الباربيتيوريك، تعتمد الطريقة على تفاعل اقتران حامض الباربيتيوريك مع كواشف نايتروانيلين المؤزوت في محيط قاعدي لتكوين صبغة أحادية صفراء ذائبة في الماء والتي تعطي أعلى امتصاصية عند 418 و380 و370 نانومتر للمعوضات DONA و DMNAو DPNAوعلى التوالي. أظهر منحني الامتصاصية خطاً مستقيماً والذي يؤكد على أنه يتبع قانون بير عند مدى تركيز حامض الباربيتيوريك 5-300 مايكروغرام/25 مللتر أي أن( 0.2 -12.0 ) جزء بالمليون وبمعامل امتصاص مولاري 1.998×104، 2.328×104و 2.184×104 لتر.مول-1.سم-1 للمعوضات DONA و DMNAو DPNAوعلى التوالي. وكانت دلالة ساندل للحساسية 0.0064, 0.0055 و 0.0059 مايكروغرام سم-2، بينما بلغ الخطأ النسبي من -3.365 إلى 0.904% و -3.325 إلى 0.138% و -2.053 إلى -2.679% للمعوضات DONA و DMNAو DPNAوعلى التوالي. بالإضافة إلى أن الطريقة كانت بسيطة وسريعة ولا تحتاج إلى التحكم في درجة الحرارة ولا تقنية الاستخلاص بالمذيبات، كما وتمت دراسة الظروف المثلى للتفاعل وتركيب الصبغة وثابت الاستقرارية والمتداخلات. ولقد طبقت الطريقة بنجاح لتقدير حامض الباربيتيورك في ماء نهر دجلة.https://rsci.mosuljournals.com/article_32476_9865a504f30cebb337642615f660f2be.pdfCollege of Science/ University of MosulRafidain Journal of Science1608-939122120110128Modeling and Analysis of Homojunction Silicon Solar Cellنمذجة وتحليل خلية شمسية سليكونية أحادية المفرق72793248310.33899/rjs.2011.32483ENGhada G. YouniseJournal Article20110101The analysis of solar cell performance in terms of material and microscopic device parameters is the key to understanding device performance and efficiency. The purpose of this paper is to study and analysis the (n+ p) homojunction silicon solar cell, and study for regions of solar cell which the base, depletion and emitter region after determent the parameters such a sample. And finding the quantum efficiency for this cell, and studying the effect of the recombination velocity of minority carriers and different diffusion lengths on the performance of the solar cell.تحليل أداء الخلية الشمسية بدلالة المتغيرات المادية والمايكروسكوبية هو المفتاح لفهم أداء النبيطة وكفاءتها. لذا تناول هذا البحث عمل نموذج تحليلي لخلية شمسية سليكونية أحادية المفرق من نوع ((n+p، ودراسة أجزاء الخلية وهي منطقة القاعدة، الاستنزاف والباعث بعد تحديد مواصفاتها كنموذج. وإيجاد الكفاءة الكمية، ودراسة تأثير سرعة إعادة اتحاد حاملات الأقلية وتأثير أطوال انتشار مختلفة على أداء الخلية الشمسية .https://rsci.mosuljournals.com/article_32483_b2646c6eb6bfc60971751027d667c3ba.pdf